MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015508	TGCCG	2	10	268956	268965	0 %	20 %	40 %	40 %	332715622
5502	NC_015508	CGA	2	6	269019	269024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715622
5503	NC_015508	GTTGG	2	10	269173	269182	0 %	40 %	60 %	0 %	332715622
5504	NC_015508	T	6	6	269268	269273	0 %	100 %	0 %	0 %	332715622
5505	NC_015508	T	6	6	269278	269283	0 %	100 %	0 %	0 %	332715622
5506	NC_015508	CGG	3	9	269351	269359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715622
5507	NC_015508	TGA	2	6	269399	269404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715622
5508	NC_015508	ATC	3	9	269416	269424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715622
5509	NC_015508	ATTT	2	8	269437	269444	25 %	75 %	0 %	0 %	332715622
5510	NC_015508	CGG	2	6	269555	269560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715622
5511	NC_015508	ACG	2	6	269813	269818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715622
5512	NC_015508	TTG	2	6	269867	269872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715622
5513	NC_015508	GAC	2	6	270016	270021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715622
5514	NC_015508	GAG	2	6	270128	270133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715622
5515	NC_015508	GAA	2	6	270138	270143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715622
5516	NC_015508	CCA	2	6	270403	270408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715623
5517	NC_015508	GCA	2	6	270449	270454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715623
5518	NC_015508	GATAT	2	10	270470	270479	40 %	40 %	20 %	0 %	332715623
5519	NC_015508	TTGG	2	8	270563	270570	0 %	50 %	50 %	0 %	332715623
5520	NC_015508	TGG	2	6	270582	270587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715623
5521	NC_015508	TC	3	6	270628	270633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_015508	TAT	2	6	270699	270704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_015508	GTTTAC	2	12	270726	270737	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5524	NC_015508	GAA	2	6	270740	270745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_015508	ATT	2	6	270761	270766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715624
5526	NC_015508	GCCC	2	8	270784	270791	0 %	0 %	25 %	75 %	332715624
5527	NC_015508	TGTT	2	8	270822	270829	0 %	75 %	25 %	0 %	332715624
5528	NC_015508	AAG	2	6	270848	270853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715624
5529	NC_015508	TGA	2	6	270865	270870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715624
5530	NC_015508	GAA	2	6	270885	270890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715624
5531	NC_015508	CG	4	8	270945	270952	0 %	0 %	50 %	50 %	332715624
5532	NC_015508	GTT	2	6	270971	270976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715624
5533	NC_015508	GC	3	6	271021	271026	0 %	0 %	50 %	50 %	332715624
5534	NC_015508	CTT	2	6	271183	271188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715624
5535	NC_015508	CGG	2	6	271274	271279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715624
5536	NC_015508	TGA	2	6	271282	271287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715624
5537	NC_015508	AGT	2	6	271394	271399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715624
5538	NC_015508	TG	3	6	271447	271452	0 %	50 %	50 %	0 %	332715624
5539	NC_015508	TGT	2	6	271486	271491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715624
5540	NC_015508	ATT	2	6	271502	271507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715624
5541	NC_015508	GCT	2	6	271511	271516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715624
5542	NC_015508	TC	3	6	271553	271558	0 %	50 %	0 %	50 %	332715624
5543	NC_015508	G	6	6	271572	271577	0 %	0 %	100 %	0 %	332715624
5544	NC_015508	ATT	2	6	271669	271674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715625
5545	NC_015508	AGC	3	9	271789	271797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715625
5546	NC_015508	GCA	2	6	271805	271810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715625
5547	NC_015508	AGT	2	6	271825	271830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715625
5548	NC_015508	CA	3	6	271858	271863	50 %	0 %	0 %	50 %	332715625
5549	NC_015508	CTTCG	2	10	271892	271901	0 %	40 %	20 %	40 %	332715625
5550	NC_015508	TCT	2	6	271912	271917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715625
5551	NC_015508	TTC	2	6	271971	271976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715625
5552	NC_015508	TCG	2	6	271983	271988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715625
5553	NC_015508	GGC	2	6	272036	272041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_015508	ACG	2	6	272168	272173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_015508	CTTC	2	8	272241	272248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_015508	TCA	2	6	272332	272337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_015508	CGA	2	6	272343	272348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_015508	AC	3	6	272416	272421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_015508	TCG	2	6	272442	272447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_015508	TA	3	6	272524	272529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_015508	CTTT	2	8	272532	272539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5562	NC_015508	TA	3	6	272591	272596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_015508	ATT	2	6	272613	272618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_015508	TCA	2	6	272636	272641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_015508	AATG	2	8	272659	272666	50 %	25 %	25 %	0 %	332715626
5566	NC_015508	CGC	2	6	272691	272696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715626
5567	NC_015508	TTC	2	6	272697	272702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715626
5568	NC_015508	TTG	2	6	272717	272722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715626
5569	NC_015508	GCA	2	6	272733	272738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715626
5570	NC_015508	GGT	2	6	272746	272751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715626
5571	NC_015508	CAA	2	6	272787	272792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715626
5572	NC_015508	GTG	2	6	272794	272799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715626
5573	NC_015508	CTG	2	6	272855	272860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715626
5574	NC_015508	GCC	2	6	272861	272866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715626
5575	NC_015508	TTC	2	6	272925	272930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715626
5576	NC_015508	GCT	2	6	272957	272962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715626
5577	NC_015508	C	6	6	272964	272969	0 %	0 %	0 %	100 %	332715626
5578	NC_015508	ACG	2	6	272975	272980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715626
5579	NC_015508	TCT	2	6	272994	272999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715626
5580	NC_015508	CTC	2	6	273118	273123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715626
5581	NC_015508	GTC	2	6	273146	273151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715626
5582	NC_015508	CCG	2	6	273287	273292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715626
5583	NC_015508	CGG	2	6	273325	273330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715626
5584	NC_015508	TTCC	2	8	273338	273345	0 %	50 %	0 %	50 %	332715626
5585	NC_015508	ATT	2	6	273368	273373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715626
5586	NC_015508	GGC	2	6	273451	273456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715626
5587	NC_015508	TTC	2	6	273458	273463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715626
5588	NC_015508	TGG	2	6	273476	273481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715626
5589	NC_015508	GA	3	6	273496	273501	50 %	0 %	50 %	0 %	332715626
5590	NC_015508	CCG	2	6	273674	273679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715626
5591	NC_015508	CCTT	2	8	273729	273736	0 %	50 %	0 %	50 %	332715626
5592	NC_015508	ACC	2	6	273743	273748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715626
5593	NC_015508	ATG	2	6	273806	273811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715626
5594	NC_015508	ACA	2	6	273846	273851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715626
5595	NC_015508	GTTG	2	8	273946	273953	0 %	50 %	50 %	0 %	332715626
5596	NC_015508	GCCA	2	8	273967	273974	25 %	0 %	25 %	50 %	332715626
5597	NC_015508	GGC	2	6	274036	274041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715626
5598	NC_015508	CCGC	2	8	274124	274131	0 %	0 %	25 %	75 %	332715626
5599	NC_015508	CAA	2	6	274195	274200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715626
5600	NC_015508	TTG	2	6	274271	274276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715626
5601	NC_015508	ACG	2	6	274281	274286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715626
5602	NC_015508	TA	3	6	274298	274303	50 %	50 %	0 %	0 %	332715626
5603	NC_015508	GGCT	2	8	274334	274341	0 %	25 %	50 %	25 %	332715626
5604	NC_015508	GAA	2	6	274406	274411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715626
5605	NC_015508	GT	3	6	274413	274418	0 %	50 %	50 %	0 %	332715626
5606	NC_015508	ACG	2	6	274428	274433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715626
5607	NC_015508	GT	3	6	274461	274466	0 %	50 %	50 %	0 %	332715627
5608	NC_015508	CCT	2	6	274467	274472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715627
5609	NC_015508	T	7	7	274493	274499	0 %	100 %	0 %	0 %	332715627
5610	NC_015508	CGA	2	6	274596	274601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715627
5611	NC_015508	GTT	2	6	274633	274638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715627
5612	NC_015508	TGG	2	6	274652	274657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715627
5613	NC_015508	A	6	6	274729	274734	100 %	0 %	0 %	0 %	332715627
5614	NC_015508	AAG	2	6	274844	274849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715627
5615	NC_015508	CAT	2	6	274872	274877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715627
5616	NC_015508	CGC	2	6	274884	274889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715627
5617	NC_015508	ATG	2	6	274918	274923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715627
5618	NC_015508	TTG	2	6	275084	275089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715627
5619	NC_015508	GC	3	6	275113	275118	0 %	0 %	50 %	50 %	332715627
5620	NC_015508	GAA	2	6	275178	275183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715627
5621	NC_015508	GCT	2	6	275205	275210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715627
5622	NC_015508	ACT	2	6	275301	275306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715627
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5624	NC_015508	TCA	2	6	275342	275347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715627
5625	NC_015508	GCG	2	6	275443	275448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715627
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5627	NC_015508	ATC	2	6	275476	275481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715627
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5744	NC_015508	TCCAT	2	10	281844	281853	20 %	40 %	0 %	40 %	332715632
5745	NC_015508	CAA	2	6	281885	281890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715632
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5747	NC_015508	GGTT	2	8	282000	282007	0 %	50 %	50 %	0 %	332715632
5748	NC_015508	CCT	2	6	282026	282031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5749	NC_015508	GCGATC	2	12	282134	282145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332715633
5750	NC_015508	CGT	2	6	282146	282151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715633
5751	NC_015508	CT	3	6	282196	282201	0 %	50 %	0 %	50 %	332715633
5752	NC_015508	TCG	2	6	282271	282276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715633
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5764	NC_015508	GGA	2	6	283001	283006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5767	NC_015508	AGC	2	6	283121	283126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5768	NC_015508	CG	3	6	283204	283209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5769	NC_015508	TAAG	2	8	283237	283244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5770	NC_015508	TTAT	2	8	283354	283361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5771	NC_015508	GATCG	2	10	283387	283396	20 %	20 %	40 %	20 %	332715635
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5990	NC_015508	TGTCAG	2	12	294139	294150	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332715645
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